Oddělení imunogenetiky (OIG) zajišťuje HLA typizaci (Human Leukocyte Antigens - český překlad: antigeny tkáňové slučitelnosti) pro orgánové transplantace a monitorování HLA-specifických protilátek před a po transplantaci pro diagnostiku protilátkami zprostředkované rejekce. Pro Český registr dárců krvetvorných buněk (ČREG) provádí HLA typizace dobrovolných dárců a vyšetřování pacientů a jejich dárců před transplantací krvetvorných buněk.