V rámci oddělení je zřízeno Antibiotické středisko, které provádí vyšetření nezbytná pro cílenou antimikrobiální léčbu a sleduje vývoj rezistence klinicky významných mikroorganismů.
OKM poskytuje konzultace v oblasti mikrobiologické diagnostiky a antibiotické terapie (MUDr. Petkov, MUDr. Němcová, MUDr. Skružná).